目前加入《马德里协定》及其《议定书》的国家已经达95个。国际商标申请人可仅需直接向所属国商标主管部们提出申请，不必再委托其他国外的商标代理人或组织办理;申请人仅需用一种文字(法文，英文或者西班牙文)提交一份简单的申请书，即可同时指定一个或多个国家甚至所有这些国家，在一个或多个商品/服务类别上申请商标国际注册，申请方式大大方便。在规费的支付上，申请人可以一次性以人民币向原属局的主管机关或以法郎向国际局直接支付。
而相对于以向这些国家逐一申请注册的情况，可以免去了分别需向不同国家商标主管机关使用不同语言、提交不同要求的申请书、支付不同种类外币等等的繁琐程序。因此可以说，马德里体系的商标申请手续非常简便。
商标马德里国际注册的费用包括三部分，一是基础注册费，二是指定国家的费用，三是本国商标主管机关的费用。
国际商标注册申请人可以在一份申请中指定一个或者多个国要求对其申请商标进行，无论指定一个国还是指定全部国，商标国际注册申请人均只需缴纳一份基础注册费，因此，指定的国家越多越合算。
缴纳的申请费以法郎计算的统一规费，或根据“议定书”再缴纳单独规费，而无须逐一向每一个指定的国家分别交费。另外，根据“协定”及“议定书”，国际注册申请人可不经过代理人，直接向本国的商标主管机关提出注册申请，从而可节省一笔代理费。从数额上看，国际注册费大大低于分别向每个国家申请注册的费用，后者一般包括该国商标注册规费、代理费和翻译费等。商标申请人在马德里所有国就一个类别申请商标注册所需的费用是逐一国家申请注册所需费用的1/12～1/11。因此，费用明显低廉。
申请人从向商标局提交商标国际注册申请之日起，如果手续齐备并按缴纳费用，一般六个月左右即可取得世界知识产权组织(WIPO)国际局颁发的商标国际注册证明。其上载明商标的国际注册号和国际注册日。不过，该国际商标注册证明只是表明国际局收到了国际注册申请，并经审查符合国际局的要求，已经或者即将把该申请提交给各指定国进行审查。该商标能否在各指定国获准注册，还是要以各指定国的审查为准。
根据“协定”和“议定书”的，该商标申请自国际局登记此项国际注册之日起十二个月(协定)或十八个月(议定书)内，申请人指定国家的商标主管机关有权驳回这一领土延伸申请，也就是说，从国际注册日起，如果被指定国在上述的期限内没有向国际局发出驳回通知，该商标将在该指定国自动得到。显然，申请人在十二个月或十八个月左右的时间内，就能知道自己的国际注册商标在各有关国家是否得到。
对于那些实际审查期限非常长的国家，此种大大缩短了申请人为得到该国的商标注册而需等待的时间。比如意大利，如果到该国单独提出商标注册申请，正常情况下获得商标注册的时间约为3年-4年，而通过马德里国际注册体系，从申请到取得商标国际注册证书，再到意大利按能够花费的审查期限，全部时间加起来最长不超过20个月，比单独申请注册的时间短很多。
申请人提出商标国际注册申请后，便可获得国际局颁发的国际注册证，获得对应的国际注册号。通过该国际注册号，即可界知识产权组织网站上对自己所申请注册的商标指定各个缔约方的审查情况进行查询。申请人也可通过该国际注册号直接向国际局办理商标的后续事宜，比如变更、转让、续展、注销等。因此，通过马德里体系申请商标国际注册使得申请人对自身的商标管理更为便捷。