2005年，洪永淼受聘到厦门大学创办“王亚南经济研究院”。短短几年，小小的研究院已成为中国乃至亚太地区一个活跃、有影响力的经济学研究机构。洪永淼也成为拥有发展中国家科学院院士、中央组织部“千人计划”入选者、教育部“长江学者”教授、美国康奈尔大学经济学系终身教授等头衔的国际知名经济学家。
他曾是经济学的“门外汉”，一次偶然机会让他“窥见”经济学的门径，误打误撞中他将物理方法引入计量经济学的研究中，竟收获了自己对于经济学研究的一片广阔天地。
他是站在中国计量经济学塔尖的人物，开拓性地提出的用于非线性时间序列分析广义谱函数被诺贝尔经济学获得者克莱夫·格兰杰等著名学者在其著作中予以详细介绍。
他就是洪永淼，拥有发展中国家科学院院士、中央组织部“千人计划”入选者、教育部“长江学者”教授、美国康奈尔大学经济学系终身教授等头衔的国际知名经济学家。
2005年，洪永淼受聘到母校厦门大学创办“王亚南经济研究院”，在这个一开始就注定具有鲜明“国际化”特色的研究院，洪永淼将自己国际化办学的思和想法运用得淋漓尽致。短短几年，小小的研究院已成为中国乃至亚太地区一个活跃、有影响力的经济学研究机构、高级人才培养和国际学术交流中心。2010年，厦门大学任命洪永淼同时兼任该校经济学院院长。从此，洪永淼致力于“用国际语言讲好中国经济故事”的学术道更具挑战、更为漫长。
1981年，洪永淼进入厦门大学物理系学习。在大的影响下，洪永梦见放鞭炮淼开始对经济学产生了浓厚兴趣。
1985年，国家教委和美中经济学教育与研究交流委员会在中国人民大学设立了经济学培训中心，开办“福特班”，介绍现代经济学。作为物理系一年级的硕士研究生，洪永淼以优异成绩考上了“福特班”，成为了第二期学生，从此结缘经济学。
结束了一年的培训，洪永淼回到厦门大学经济系，捧起了经济学的专著潜心钻研。1988年，厦门大学经济学专业硕士毕业后，洪永淼继续赴美深造。
到了美国大学分校以后，洪永淼发现该校最强势的学科不是货币经济学，是他之前从未听说过的计量经济学，而该校也是当时在全世界享有盛誉的少数几个计量经济学的“学术高地”。
出人意料的是，物理背景出身的洪永淼，借鉴物理学的分析方法，竟为他从事计量经济学的研究提供了巨大帮助。他首次提出的广义谱函数分析方法，可用于分析各种形式的非线性时间序列，这个方法是对物理学频谱分析的一个创新。
为师者，教人求线世纪以来，在经济全球化浪潮的推动下，中国经济学的教育与研究如何国际化并与本土化相结合、如何打造“中国特色、世界一流”经济学科，成为国内学界探讨的热门线年，厦门大学计划成立一个与国际接轨的现代经济学研究中心。身为厦门大学校友的洪永淼成为校方看重的不二“掌门人”人选。经过慎重考虑，洪永淼决定接受母校邀请，筹建王亚南经济研究院。
当时，关于研究院的命名，有过各种不同的提议。洪永淼希望这个研究院在全国能充分体现厦大特色，“王亚南”无疑是最有特色的“元素”。王亚南是中国现代著名经济学家、教育家，曾与郭大力合译了《资本论》，创立了具有鲜明特色的“厦大经济学派”。“以他来命名，别人一听就能想起厦门大学经济学的辉煌历史。同时，我也希望我们能够学习王亚南先生的治学和科学。”洪永淼说。
怀着“要建设一个国内最好的经济学研究机构”的目标，洪永淼在研究院的小天地里大展。他立足厦门大学与中国经济学教育和研究现实，以“国际化”为主线，从师资队伍、课程体系、人才培养质量等关键方面入手，创制度、立规矩，让研究院从一开始便从头到脚充盈着“创新”因子。在洪永淼和同事们的用心经营管理下，短短几年，研究院开始在“圈内”声名鹊起。
“第一刀”便对准了教学。一上任，洪永淼花了两个多月的时间深入各系、所和中心，大走访、大摸底，了解经济学院教学现状及存在的问题。3个月后，《经济学院教学管理条例》（以下简称《条例》）“出炉”。这本改了十几稿、近百页的绿皮小对该院学生管理、考试管理、任课教师教学管理等涉及教学的14个方面作出了详细而具体的。
在研究生课程体系上，学院在原来课程基础上，将原来一学期修完的“三高”增加到两学期修完，同时增加数理经济学、金融经济学共八门课（学生戏称“八高”）。学业负担陡然加重，这让不少学生产生了意见。“然而，一段时间后的实践表明，这些经济学基础课程大幅提高了学生的水平。”学生们开始渐渐理解学院的“良苦用心”。
为了让厦大经济学教育与国际接轨，在学校有关领导与部门支持下，洪永淼在经济学院创办国际化试点班，从本科一年级起便实行专业课程全英文教学模式。让他没想到的是，这居然也会招致一些师生甚至的，有人甚至这是“西化的教育”。
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